急性SCF最初的临床症状有食欲减退、嗜睡、结膜炎、呼吸困难、先便秘后腹泻。慢性SCF时也出现类似症状，但是病猪能生存2~3个月，同时一些非特异性的症状例如间歇热、慢性肠炎、消瘦也会出现。
一般情况下,最急性、急性、慢性及产前形成的SCF表现形式与病毒的毒力密切相关,但是由于不同日龄、品种、健康状态及免疫状态的猪对同一毒株的敏感性不同，所以SCFV的毒力是很难界定的。
SCF是能引起皮肤充血或发绀及非特异性临床症状的数种疫病之一，特别是感染了低毒力的SCFV毒株，从临床症状上很难与非洲猪瘟(ASF)、猪繁殖与呼吸障碍综合征(PRRS)及断奶仔猪皮炎和肾病综合征(PDNS)、沙门氏菌病或者香豆素中毒区分。SCF最常见的症状是超过40°C的高烧(140℉)，仔猪聚堆于墙角,仔猪的临床症状比成年猪明显，成年猪体温要低一些(40°C,140℉))。
SCFV在妊娠的任何时期都能通过胎盘感染胎儿,是否导致流产和死胎取决于感染的毒株和妊娠的时间。然而,在妊娠50~70d感染时，出生仔猪会有持续性的病毒血症,这些仔猪最初没有临床症状,但是这些猪会被淘汰或者发生先天性震颤，这种感染被称为“迟发型SCF"，与反刍动物的BVDV相似，这种猪能持续向外排毒数月，是SCFV重要的存储宿主。
根据病毒毒力和宿主反应不同，猪在感染SCFV 3~6 d后出现临床症状、或者死亡、或者恢复、或者是继发慢性疾病。SCFV感染后有一定的潜伏期,感染毒力较低的毒株时病程持续13~19 d。由于感染后特别是感染中等或低毒力毒株时不会表现出明显的临床症状，容易被忽略，因此SCFV感染后4~8周内通常检测不到，这进一步增强了其传播的风险。
